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Foi disponibilizado a função de fórmula TIPOPAGAMENTO, ao definir essa função no desconto do Parâmetros no TOTVS Financeira | Contas a Receber | Manutenção de Lançamentos | Lançamentos | Inclusão | Formulas / Valores Defaults para Desconto, será aplicado esse desconto conforme o meio de pagamento selecionado no portal.

TIPOPAGAMENTO
0 = Crédito
1 = Débito
2 = PIX (disponível para versões acima da 12.1.2829)
Quando o tipo de pagamento é null ou não é informado, não será passado nenhum meio de pagamento default.

Exemplo de fórmula: Nessa fórmula será aplicado desconto se o meio de pagamento for crédito. 
SE TIPOPAGAMENTO = '0'  ENTAO 100 SENAO 0
O valor do boleto é R$1.000, conforme a fórmula definida será aplicado um desconto de R$100 por pagamento com cartão de crédito.