O TOTVS Agro Bioenergia permite a configuração completa de taxas com observância às suas particularidades, como percentual de alíquota, índice de ajuste, base de cálculo, etc. Tais taxas são vinculadas aos fundos agrícolas e as mesmas são apuradas durante os fechamentos. Na nota fiscal, exemplo clássico, os valores são descontados do bruto e armazenados em tabela própria. Neste conjunto de APIs as informações são disponibilizadas em sua íntegra facilitando indicando, inclusive, à qual processa ela se refere (Folhas de Pagamento, Adiantamentos ou Notas Fiscais).